函館本線

路線の起源は北海道における鉄道発祥にさかのぼる。1880年（明治13年）から1882年（明治15年）にかけて、官営幌内鉄道が手宮駅（小樽市・現在廃止）- 札幌駅 - 幌内駅（三笠市・現在廃止）間を開通させた。これは岩見沢付近の炭鉱の石炭を小樽方面へ運ぶことを目的としたもので、札幌駅 - 岩見沢駅間は1882年に開業した。1889年（明治22年）に官営幌内鉄道の路線は私鉄の北海道炭礦鉄道へ譲渡され、同社は1891年（明治24年）に岩見沢駅 - 砂川駅間を延伸した。さらに北海道庁が運営する北海道官設鉄道が上川線として空知太駅 - 旭川駅間を建設し、1898年（明治31年）7月16日に開業した。

函館側は、千歳線を建設した2代目とは別会社である北海道鉄道（初代）によって別途建設された。1902年（明治35年）12月10日に函館駅（初代）- 本郷駅間および然別駅 - 蘭島駅間が開業し、1903年・1904年にかけて延伸された。1905年（明治38年）8月1日に高島駅 - 小樽駅（初代）間が開業して函館駅 - 旭川駅間が全通した。これらの私鉄各線はその後国有化され、北海道官設鉄道は1905年に鉄道作業局（国有鉄道）へ編入、北海道炭礦鉄道の小樽駅（初代）- 空知太駅間は1906年（明治39年）10月1日に鉄道国有法によって、北海道鉄道（初代）の函館駅 - 小樽駅間は1907年（明治40年）7月1日にそれぞれ国有化された。1909年（明治42年）10月12日、国有鉄道線路名称の制定により、函館駅 - 旭川駅間が「函館本線」と命名された。

以後、各区間で段階的に複線化が進められ、急勾配を緩和するための信号場・別線・ルート変更が設けられた。大沼駅 - 渡島砂原駅 - 森駅間（砂原支線）は、第二次世界大戦中の輸送力増強のため駒ヶ岳回りの急勾配を避けるバイパスとして建設されたもので、森駅 - 砂原駅間の渡島海岸鉄道は1945年（昭和20年）1月25日に買収・国有化されて函館本線に編入され、同年6月1日に森駅までの支線が全通した。電化は戦後に行われ、小樽駅 - 滝川駅間は1968年（昭和43年）8月28日に交流20,000 V・50 Hzで電化、滝川駅 - 旭川駅間は1969年（昭和44年）10月1日に電化された。函館駅 - 五稜郭駅間は、青函トンネルを通る海峡線の開業に合わせて1988年（昭和63年）3月13日に電化された。

高速道路や航空との競争が激化し、並行する室蘭本線・千歳線が改良されると、長万部駅 - 札幌駅間の「山線」は長距離特急の地位を失い、1986年（昭和61年）10月をもって同区間の優等列車はすべて廃止された。現在、函館駅 - 旭川駅間を通して運行する列車はなく、路線は性格の異なる複数の区間に分かれている。函館駅 - 長万部駅間は特急「北斗」や2016年に新設された「はこだてライナー」が走り、小樽駅 - 札幌駅 - 旭川駅間は普通・快速（快速エアポートを含む）や特急「カムイ」「ライラック」「宗谷」「オホーツク」が頻繁に運行される電化幹線となっている。

1987年（昭和62年）4月1日の国鉄分割民営化に伴い、JR北海道が第一種鉄道事業者として全線を承継し、JR貨物が貨物区間の第二種鉄道事業者となった。2016年（平成28年）3月26日、北海道新幹線の新青森駅 - 新函館北斗駅間開業に伴い、渡島大野駅が新函館北斗駅に改称され、五稜郭駅 - 新函館北斗駅間が電化された。新函館北斗駅以北の北海道新幹線は函館本線にほぼ並行する。新幹線の札幌延伸を前に、南側区間の去就は一部決まっており、2022年（令和4年）3月27日、北海道と沿線自治体は延伸開業後に長万部駅 - 小樽駅間を廃止しバスへ転換することで合意した。一方、函館駅 - 長万部駅間は北海道と本州を結ぶ貨物の大動脈であるため、別途協議が続いている。

主な事故としては、1976年（昭和51年）10月2日に駒ヶ岳駅 - 姫川信号場間で貨物列車が脱線し、貨車41両中40両とディーゼル機関車が転覆する事故があり、日本語の出典はこれを国鉄史上最大の脱線事故と記している。2013年8月には線路を支障した流木による脱線事故が発生し負傷者はなかったものの一時不通となり、翌9月には大沼駅構内で貨物列車が脱線し、これに伴う調査で軌道変位検査データの改ざんが発覚した。

• 188028 November: the government-run Horonai Railway provisionally opens the Temiya-Kaiuncho-Sapporo section, the first railway in Hokkaido.
• 188213 November: the Sapporo-Iwamizawa extension opens, completing the Horonai Railway's Temiya-Horonai line, built to carry coal to Otaru port.
• 188911 December: the Horonai Railway's lines are transferred to the private Hokkaido Colliery and Railway Company.
• 18915 July: the Hokkaido Colliery and Railway Company extends the line from Iwamizawa to Sunagawa.
• 189816 July: the Hokkaido Government Railways' Kamikawa Line opens from Sorachibuto to Asahikawa.
• 190210 December: the (first) Hokkaido Railway Company opens its first Hakodate-side sections (Hakodate-Hongo; Shikaribetsu-Ranshima).
• 19051 August: the Takashima-Otaru section opens, completing a through route between Hakodate and Asahikawa.
• 19061 October: the Hokkaido Colliery and Railway Company's Otaru-Sorachibuto section is nationalised under the Railway Nationalization Act.
• 19071 July: the first Hokkaido Railway Company's Hakodate-Otaru section is nationalised.
• 190912 October: under the state railway line-naming scheme, the Hakodate-Asahikawa route is formally named the Hakodate Main Line.
• 194525 January: the Watarishima Coast Railway (Mori-Sawara) is nationalised and incorporated as the Sawara branch; the branch through to Mori is completed on 1 June.
• 196828 August: the Otaru-Takikawa section is electrified at 20,000 V 50 Hz AC.
• 19691 October: the Takikawa-Asahikawa section is electrified.
• 19762 October: a freight train derails between Komagatake and Himekawa; 40 of 41 wagons and a locomotive overturn, described by the JA source as the largest derailment in JNR history.
• 1986October: all limited-express/express services on the Oshamambe-Sapporo section are withdrawn in favour of the coastal route.
• 19871 April: JNR is privatised; JR Hokkaido takes over the whole line as Class-1 operator and JR Freight becomes Class-2 operator on freight sections.
• 198813 March: the Hakodate-Goryokaku section is electrified in conjunction with the opening of the Kaikyo Line (Seikan Tunnel).
• 2013August: a freight train derails near Yakumo after striking wood on the track (no injuries). September: a freight train derails at Onuma Station, exposing falsification of track-inspection data.
• 201626 March: with the Hokkaido Shinkansen opening to Shin-Hakodate-Hokuto, Oshima-Ono is renamed Shin-Hakodate-Hokuto, the Goryokaku-Shin-Hakodate-Hokuto section is electrified, and the Hakodate Liner is introduced.
• 202227 March: the prefecture and lineside municipalities agree to close the Oshamambe-Otaru section after the Hokkaido Shinkansen extension to Sapporo and convert it to bus routes.